Stanowisko doktoranta w naukach przyrodniczych, specjalność biologia

Stanowisko doktoranta w Naukach Przyrodniczych, specjalność biologia

Ewolucja oparta na danych i różnorodność biologiczna obejmuje badania wykorzystujące ogromne zbiory danych generowane przez techniki takie jak sekwencjonowanie genomów i biomów o wysokiej przepustowości, ciągłe nagrywanie wideo i dźwięku w środowiskach naturalnych, obrazowanie próbek biologicznych o wysokiej przepustowości oraz zdalne monitorowanie organizmów lub siedlisk na dużą skalę.

W ramach tego szkolenia doktoranckiego będziesz badać, jak cechy organizmów i genomy rozwijają się pod wpływem doboru darwinowskiego. Opracujesz nowe metody matematyczne i obliczeniowe, aby zrozumieć adaptację w złożonych środowiskach, gdzie różne presje selekcyjne stawiają sprzeczne wymagania biologii komórki i prowadzą do skomplikowanych kompromisów. Na przykład lepsza wydajność w wysokich temperaturach często odbywa się kosztem gorszej wydajności w niskich temperaturach, a oporność bakterii na antybiotyki często wiąże się z wolniejszym wzrostem przy braku antybiotyków.

Z tej perspektywy dobór darwinowski można postrzegać jako wielocelowy problem optymalizacyjny, gdzie selekcja dąży do zrównoważenia kosztów i korzyści różnych cech, aby optymalnie umiejscowić organizmy w wielowymiarowej przestrzeni cech. Zbadasz, czy wielocelowe algorytmy optymalizacyjne (MOO), często stosowane w inżynierii, mogą pomóc nam zrozumieć, jak organizmy dostosowują się i ewoluują.

Będziesz analizować duże wielowymiarowe zbiory danych dotyczące sekwencji genomów i dostosowania organizmów, korzystając z technik MOO, uczenia maszynowego i badań asocjacyjnych obejmujących cały genom. Drożdże i bakterie będą twoimi głównymi organizmami modelowymi, ale opracowane przez ciebie ramy analityczne będą szeroko stosowane.

Ogólne informacje o byciu doktorantem na Uniwersytecie w Göteborgu znajdują się na stronach internetowych uniwersytetu dla doktorantów:

Wspólne informacje uniwersyteckie o tym, co oznacza bycie doktorantem na Uniwersytecie w Göteborgu, można znaleźć na stronach uniwersytetu dla doktorantów.